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밀릴때마다 물량 모아둘 기회로 보이며 이후 전망 및 대응전략. 2026/03/30 20:36

개미신사

미국 특허심판원(PTAB)이 유전자가위 기술 글로벌 특허 분쟁에서 미국 브로드연구소의 손을 들어준 가운데 국내 기업 툴젠의 주가가 급등했다. 특허 경쟁 구도상 불리한 결과로 해석될 수 있는 판결에도 시장이 긍정적으로 반응하면서 그 배경에 관심이 쏠린다.

업계에선 '3파전'으로 진행 중인 유전자가위 치료제 특허 분쟁이 분기점을 맞았다는 점을 주가 상승의 배경으로 지목한다. 장기간 이어진 분쟁으로 불확실했던 특허 구도가 일정 부분 정리되면서 향후 권리 관계와 수익 구조를 가늠할 수 있게 됐다는 분석이다.

3월30일 제약·바이오 업계에 따르면 PTAB은 CRISPR-Cas9 유전자가위 기술을 인간 세포에 적용하는 '원천기술'을 둘러싼 UC버클리·샤르팡티에(CVC) 그룹과 브로드연구소의 저촉심사 환송심에서 브로드연구소의 우선권을 인정하는 결정을 내렸다. 유전자가위를 인간 세포에서 실제로 작동시키는 핵심 기술을 CVC가 아닌 브로드연구소가 먼저 구현했다는 판단이다.

이번 판결은 툴젠에 불리한 결과로 해석될 수 있다. 툴젠 역시 관련 특허를 출원하며 원천기술 권리 확보를 시도해왔기 때문이다. 하지만 같은 날 툴젠 주가는 전날 대비 약 20% 상승했다.

업계에선 투자자들이 특허 분쟁의 향방이 가시화된 점에 주목했다는 분석이 나온다. 그동안 특허 귀속이 명확하지 않아 기술 상업화나 로열티 구조를 예측하기 어려웠는데, 이번 판결로 큰 방향이 잡히면서 투자 판단이 가능해졌다는 것이다.

툴젠 관계자는 "브로드와 CVC 간 결론이 나오면서 그동안 지연됐던 툴젠 저촉심사 다음 단계도 진행될 수 있는 상황"이라며 "불확실했던 상황이 해소되면서 기대감이 반영된 것으로 본다"고 설명했다.

저촉심사는 동일한 기술을 두고 복수의 출원자가 있을 때 누가 먼저 발명했는지를 가리는 절차다. 1단계에서는 주장과 증거를 정리하고 이후 실제 발명 시점을 판단하는 2단계로 이어진다. 툴젠은 이미 1단계를 통과했지만 그간 CVC와 브로드연구소 간 항소로 2단계 진입이 지연돼 왔다. 이번 결정으로 2단계 절차가 재개될 가능성이 커지면서 시장 기대가 반영됐다는 설명이다.

유전자가위 기술 특허 경쟁의 무게중심이 점차 응용기술로 이동할 것이라는 전망도 주가 상승에 영향을 미친 것으로 보인다. 툴젠은 유전자가위 치료제 상용화에 핵심 역할을 하는 RNP(리보핵산-단백질 복합체) 전달기술 관련 특허를 확보하고 있다.

RNP 전달기술이 치료제 개발 과정에서 필수적인 기술로 자리 잡을 경우 원천기술 특허와 별도로 추가적인 로열티 구조가 형성될 가능성이 제기된다. 이렇게 되면 유전자가위 치료제를 개발하는 글로벌 제약사가 RNP 기술 사용을 위해 특허를 보유한 기업과 별도의 라이선스 계약을 체결해야 한다. 미국 식품의약국(FDA) 승인을 받은 유일한 유전자가위 치료제 '카스거비'에도 RNP 기술이 적용된 것으로 알려졌다. 툴젠은 카스거비를 개발한 버텍스 파마슈티컬스 등을 상대로 관련 소송을 진행 중이다.

CRISPR-Cas9은 원하는 유전자를 정밀하게 잘라내고 교정하는 기술이다. 겸상적혈구병 등 난치질환 치료의 '게임체인저'로 불린다. 한 번의 치료로 질병 원인을 근본적으로 제거한다는 점에서 차세대 유전자 치료 기술로 주목받는다.

유전자가위 치료제의 핵심인 CRISPR-Cas9 기술을 둘러싼 특허 분쟁은 2010년대 초반부터 이어졌다. 기술의 기본 원리를 규명한 CVC와 이 기술을 인간 세포에서 실제로 작동하도록 구현한 브로드연구소 간 소송전이 중심이다. 여기에 툴젠도 관련 특허를 먼저 출원하며 분쟁에 참여하고 있다. 글로벌 시장조사기관 모르도르 인텔리전스에 따르면 유전자가위 치료제 시장 규모는 2025년 45억3000만달러(약 6조8371억원)에서 2030년 112억3000만달러(약 16조9494억원)로 수직 상승할 전망이다.

유종상 툴젠(199800) 대표가 글로벌 크리스퍼 유전자 가위 원천특허 분쟁과 관련해 “올 하반기 초부터 즉 7~8월쯤에는 사실상 본게임이 시작된다”고 강조했다. 그간 지연돼 온 우선권 판단 절차가 재개될 가능성이 커지면서, 경쟁사 간 합의 가능성도 동시에 높아질 것이란 판단이다.

유 대표는 최근 이데일리 제약·바이오 프리미엄 콘텐츠 팜이데일리와 진행한 인터뷰에서 “CVC와 브로드 간 저촉심사에 대한 미국 특허심판원(PTAB)의 환송(remand) 결정이 나오면, 해당 분쟁의 승자와 툴젠 사이의 저촉심사(interference)가 즉시 재개될 것”이라며 “이 경우 연내 저촉심사 2단계인 프라이어리티 페이즈가 본격화될 가능성이 높다”고 말했다.

크리스퍼 카스9(CRISPR-Cas9) 진핵세포 원천특허 분쟁은 2010년대 초 관련 기술이 등장한 이후 10년 넘게 이어진 글로벌 특허전이다. 툴젠과 미국 매사추세츠공대(MIT)·하버드대가 공동설립한 브로드연구소, UC버클리대학교·빈대학교·노벨화학상 수상자 에마뉘엘 샤르팡티에로 구성된 CVC그룹이 유사 기술을 각각 출원하면서 충돌이 시작돼 현재 PTAB에서 저촉심사가 진행 중이다. 쟁점은 누가 진핵세포에서 해당 기술을 먼저 구현했는지, 즉발명의 우선권에 있다. 최종 승자가 글로벌 유전자 교정 시장의 핵심 권리를 확보하게 되는 만큼 업계의 관심이 집중되고 있지만 소송전은 지지부진한 상태다.

유 대표가 저촉심사의 속도가 빨라질 것으로 판단하는 근거는 PTAB이 지난 1월 CVC 및 브로드의 반대에도 불구하고 툴젠의 저촉심사 속행 요청을 받아들였기 때문이다. 기존에는 CVC-브로드 간 저촉심사 결과가 확정돼야만 툴젠과의 후속 심사가 진행되는 구조였고, 패소 측이 항소할 경우 절차 전체가 장기간 지연되는 문제가 있었다. 실제 지난 2022년 CVC가 항소하면서 툴젠의 특허 수익화 일정 역시 계속 뒤로 밀렸다.

이 때문에 툴젠이 연루된 크리스퍼 카스9 진핵세포 원천특허 분쟁은 저촉심사 절차 내 1단계인 모션 페이즈까지만 진행된 상태다. 핵심 쟁점인 ‘누가 먼저 발명했는지’를 가리는 2단계 프라이어리티 페이즈는 아직 개시되지 않았다.

유 대표는 “프라이어리티 페이즈는 단순한 절차가 아니라 특허의 귀속을 좌우하는 결정적 단계”라며 “이 단계가 열리는 순간 분쟁의 성격 자체가 달라질 것”이라고 설명했다.

툴젠은 이미 1단계에서 선출원자(Senior Party)로 지정됐다. 이는 우선권 다툼에서 상대방이 먼저 반증 책임을 져야 한다는 의미로, 구조적으로 유리한 위치라는 게 회사 측 설명이다. 상대 진영의 주요 주장과 근거는 상당 부분 공개된 반면, 툴젠의 전략은 상대적으로 덜 노출돼 있다는 점도 변수로 작용할 수 있다는 입장이다.

유 대표는 프라이어리티 페이즈 개시가 단순히 절차 진전 이상의 의미를 가진다고 강조했다. 그는 “우선권 판단 단계로 넘어가면 각 당사자가 부담해야 할 소송 비용과 리스크가 급격히 커진다”며 “이 시점부터는 장기전보다 합의를 택하려는 유인이 커질 수밖에 없다”고 짚었다.

현재 크리스퍼 카스9 원천특허를 두고 권리 귀속이 확정되지 않은 상태가 이어지면서 산업 전반에 불확실성이 지속돼 왔다. 1호 유전자가위치료제 ‘카스거비’가 나왔지만 로열티 배분을 둘러싼 권리 관계도 완전히 정리되지 않은 상태다.

유 대표는 “특허가 명확히 정리되지 않으면 상업화 과정에서도 제약이 발생한다”며 “결국 어느 시점에서는 이해관계자 모두가 합의를 고려할 수밖에 없는 구조”라고 진단했다.

이어 “선발명자 판단과 별개로, 방대한 특허 포트폴리오 내 개별 특허에서 권리를 확보할 여지도 있다”며 “이번 분쟁은 절대적인 승자나 패자가 있는 구조라기보다, 전체 시장에서 각자의 몫을 어떻게 나눌지를 두고 다투는 성격이 강하다”고 했다. 그러면서 “툴젠 역시 이러한 관점에서 최선을 다해 소송에 임하고 있다”고 강조했다.

저촉심사 2단계 진입을 앞두고 툴젠은 특허 전략의 무게중심을 특허 확보(prosecution)에서 소송(litigation)으로 이동시키고 있다.

유 대표는 “그동안은 특허 포트폴리오를 확장하고 장벽을 높이는 단계였다면 이제는 확보한 권리를 실제로 행사하는 단계로 넘어가고 있다”고 설명했다.

최근 소송 전문가인 구본천 최고법률책임자(CLO)를 영입한 것도 같은 맥락이다. 그는 “프로스큐션(특허 출원·등록)과 리티게이션(특허 소송)은 요구되는 역량이 완전히 다른 영역”이라며 “글로벌 특허 분쟁 대응을 위해 새로운 CLO를 선임해 전문성을 강화했다”고 덧붙였다.

툴젠은 크리스퍼 카스9 원천특허와 함께 크리스퍼(CRISPR) RNP 특허를 ‘투트랙 전략’으로 제시하고 있다. 투트랙 전략을 가능케 한 배경으로 김유리 부사장과 크리스퍼 카스9 원천기술 개발을 이끈 김진수 카이스트 교수의 역할을 높이 평가했다.

유 대표는 “RNP 방식은 단백질 복합체를 직접 전달하는 구조로 기존 방식 대비 안전성과 정확도가 높다”며 “이미 상용화된 치료제(버텍스의 카스거비)에도 적용된 기술”이라고 설명했다.

툴젠은 해당 특허를 기반으로 미국에서도 권리를 확보하고 관련기업들을 상대로 침해 소송을 진행 중이다. 일부 소송에서는 당사자 간 합의가 이뤄지는 등 특허 영향력이 시장에서 일부 확인되고 있다는 입장이다.

유 대표는 마지막으로 “지금은 저촉심사와 관련된 타임라인이 회사의 예상에서 크게 벗어나지 않을 가능성이 굉장히 높다고 보고 있다”며 “주주와 툴젠에 큰 관심을 갖고 호응해주시는 분들에게 좋은 소식을 전하겠다”고 강조했다.

작년 연결기준 매출액은 13.06억으로 전년대비 46.58% 증가. 영업이익은 232.94억 적자로 217.98억 적자에서 적자폭 확대. 당기순이익은 367.64억 적자로 62.32억에서 적자전한.

국내 바이오 기업 툴젠 주가가 강세를 보이고 있다. 12월26일 한국거래소에 따르면 이날 오전 9시 17분 현재 11.92% 올라 5만 8200원에 거래되고 있다.

툴젠은 2021년 코스닥 시장에 상장하며 본격적인 성장 궤도에 올랐다.

현재 툴젠은 ZFN, TALEN, CRISPR/Cas9 등 주요 유전자가위를 모두 독자 개발한 세계 유일의 기업으로, 총 388건의 특허를 확보하며 글로벌 유전자 교정 분야에서 원천기술 보유 기업으로 안착, 주가에 훈풍을 불어 넣고 있는 것으로 보인다.

기술 자체를 수익화하는 특허 사업과 치료제·종자 연구개발을 병행하는 사업 구조는 툴젠의 가장 큰 경쟁력으로 꼽힌다.

툴젠은 유전자 교정이라는 개념조차 생소하던 1999년 관련 플랫폼 기술 개발을 목표로 출범했다. 당시만 해도 유전자 교정은 기초 연구 영역에 머물러 있었고, 상업적 활용 가능성에 대해서는 회의적인 시각이 적지 않았다. 그러나 툴젠은 장기적인 기술 축적을 선택했고, 이후 20여 년간 한 분야에 집중해왔다.

이 같은 선택은 결과적으로 툴젠을 국내는 물론 글로벌 유전자 교정 시장에서도 독보적인 위치로 끌어올렸다. 단일 기술이 아닌 여러 유전자가위 기술을 동시에 확보한 점은 연구와 산업 양 측면에서 큰 의미를 갖는다.

툴젠의 가장 큰 특징은 ZFN, TALEN, CRISPR/Cas9 등 세 가지 핵심 유전자가위 기술을 모두 자체 개발했다는 점이다. 이는 세계적으로도 유례를 찾기 힘든 사례다. 대부분의 기업이 특정 기술 하나에 집중하는 것과 달리, 툴젠은 유전자 교정 기술의 진화를 처음부터 끝까지 따라가며 기술 포트폴리오를 구축해왔다.

CRISPR/Cas9 유전자가위가 진핵세포에서 정상적으로 작동함을 세계 최초로 입증한 특허는 툴젠 기술력의 상징으로 평가된다. 이 특허는 이후 글로벌 CRISPR 기술 경쟁에서 핵심적인 원천특허 중 하나로 언급되고 있다.

툴젠이 확보한 특허는 총 388건에 달한다. 이는 단순한 숫자 이상의 의미를 지닌다. 유전자 교정 기술은 특허 장벽이 곧 진입 장벽으로 작용하는 분야다. 툴젠은 원천특허를 기반으로 기술 라이선싱과 특허 수익화 전략을 추진하며, 연구 성과를 실질적인 사업으로 연결하고 있다.

업계에서는 툴젠의 특허 포트폴리오를 두고 “기술을 쌓는 데서 그치지 않고, 지식재산(IP)을 산업 자산으로 전환한 사례”라는 평가가 나온다. 이는 바이오 기업들이 흔히 겪는 ‘연구는 있지만 수익은 없는’ 구조와 차별화되는 지점이다.

툴젠의 유전자 교정 플랫폼은 치료제 개발뿐 아니라 농업·종자 분야로도 확장되고 있다. 특정 질병을 유발하는 유전자를 정밀하게 교정하는 기술은 난치성 질환 치료의 가능성을 넓히고 있으며, 농업 분야에서는 병충해에 강한 종자 개발로 이어질 수 있다.

이는 툴젠이 단일 산업에 국한되지 않고, 유전자 교정 기술을 범용 플랫폼으로 활용하고 있음을 보여준다. 회사가 내세우는 질병 없는 건강한 삶과 풍요로운 사회라는 비전 역시 이러한 기술 확장성을 전제로 한다.

툴젠은 2021년 코스닥 시장에 상장하며 연구 중심 기업에서 시장의 평가를 받는 단계로 진입했다. 상장은 단순한 자금 조달을 넘어, 기술과 사업 모델의 지속 가능성을 증명해야 하는 과정이기도 하다.

상장 이후 툴젠은 원천특허 기반 사업과 연구개발을 병행하며, 기술 기업으로서의 정체성을 유지하고 있다. 단기 성과보다는 장기 경쟁력에 방점을 찍은 전략이라는 평가다.

유전자 교정 기술은 이제 실험실을 넘어 산업과 일상으로 이동하고 있다. 글로벌 제약사와 종자 기업들이 관련 기술 확보에 나서는 가운데, 원천특허 가치는 시간이 갈수록 부각될 가능성이 크다.

툴젠은 단기간의 화려한 실적보다는, 기술의 깊이와 범용성을 무기로 시장에 접근하고 있다. 유전자가위의 시작점에서 출발한 이 기업이 향후 치료제와 농업, 더 나아가 새로운 생명과학 산업의 표준으로 자리 잡을 수 있을지 주목된다.

유전자 교정의 미래를 둘러싼 경쟁 속에서, 툴젠은 이미 가장 중요한 무기 하나를 손에 쥐고 있다. 바로 원천기술이다.

유전자 교정 기술 선도기업 ㈜툴젠(대표 유종상)이 ㈜아비노젠(Avinnogen)과 'CRISPR-Cas9 유전자 교정 기술이전 계약'을 체결했다고 작년 11월6일 밝혔다.이번 계약은 툴젠의 CRISPR-Cas9 원천기술을 아비노젠의 '조류 생식세포 교정 플랫폼'에 접목해, 고부가가치 조류 신품종 및 난황 기반 치료용 단백질 개발을 가속화하는 것을 골자로 한다.툴젠은 국내에서 유일하게 CRISPR-Cas9 유전자 교정 원천 특허를 보유한 기업이다. 미국, 유럽, 일본 등 주요 10개국에서 총 30건의 관련 특허를 확보했으며, 이를 기반으로 몬산토(Monsanto), 써모피셔(Thermo Fisher) 등 글로벌 기업과 20건 이상의 기술이전 계약을 체결하며 기술 상용화를 주도하고 있다.

아비노젠은 지난 2022년 서울대학교 동물생명공학과의 한재용 교수가 교내 벤처로 설립한 바이오 기업이다. 한재용 교수는 동물분자유전학 전문가로, 조류 유전자 교정과 형질전환 시스템 개발에 오랜 연구 기반을 갖추고 있고, 아비노젠은 설립 이후 조류 생식세포 유전자교정 기술을 중심으로, 난황 기반 단백질 생산 및 기능성 조류 신품종 개발을 목표로 사업을 전개해 오고 있다.이번 계약으로 아비노젠은 툴젠이 보유한 CRISPR-Cas9 원천기술을 자사의 조류 생식세포 교정 플랫폼에 본격 적용해, 질병 저항성·고기능성 신품종 개발 및 치료용 단백질 생산 등 차세대 조류 바이오 분야의 연구개발을 가속화할 예정이다

.양사는 나아가 ▲CRISPR 기술의 조류 세포 적용 검증 ▲유전자 교정 기반 신품종 개발 공동연구▲치료용 단백질 생산 플랫폼 구축 ▲글로벌 시장 진출 전략 수립 등을 단계적으로 추진할 계획이다. 이번 계약은 국내 유전자교정 원천기술이 조류 생명공학 산업에 본격 접목되는 중요 사례로, 양사의 핵심 기술력이 결합된 새로운 바이오 혁신 모델로 평가받는다.계약 조건에 따라 아비노젠은 CRISPR-Cas9 기술을 활용해 다양한 목적의 유전자 교정 조류를 개발하고 상용화할 수 있는 권리를 확보했다. 툴젠은 기술 이전에 따른 선급금(Upfront fee)과 향후 매출 발생에 따른 경상로열티(Royalty) 수익을 기대할 수 있게 됐다.

툴젠 사업개발실 김정화 실장은 "CRISPR 원천기술이 조류 생명공학 분야로 확장된 의미 있는 사례"라며 "앞으로도 다양한 산업 영역에서 기술의 응용 가능성을 넓혀갈 것"이라고 말했다.아비노젠 김영민 부사장은 "툴젠의 독보적인 기술력과 아비노젠의 조류 플랫폼이 결합해 강력한 시너지를 창출하고, 새로운 바이오 혁신 모델을 만들어갈 것"이라고 강조했다.

유전자교정 제품 개발 및 서비스 전문 업체. 유전자교정 플랫폼 기술의 원천특허를 기반으로 특허수익화 사업 및 유전자교정 기술을 적용한 치료제 및 동식물 관련 제품에 대한 연구개발을 진행. ZFN(Zinc Finger Nuclease), TALEN(TAL Effector Nuclease), CRISPR(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)/Cas9과 같은 3종의 유전자가위를 모두 개발한 세계 유일 기업임.

특히, CRISPR 유전자가위를 진핵세포에서 작동하는 것을 증명한 특허를 전 세계에서 가장 빠르게 출원했으며 세계 최초로 사업화. CRISPR 유전자가위 원천특허를 보유하고 있는 아시아 유일 기업으로 주요 9개 국가(한국/미국/유럽/호주/중국/일본/싱가포르/인도/홍콩)에 원천특허 등록. 최대주주는 제넥신 외(14.12%), 주요주주는 김진수(8.6%).

2024년 연결기준 매출액은 8.91억으로 전년대비 19.22% 감소. 영업이익은 217.98억 적자로 170.88억 적자에서 적자폭 확대. 당기순이익은 62.32억으로 423.40억 적자에서 흑자전환.

2014년 6월25일 1586원에서 바닥을 찍은 후 2018년 2월28일 131144원에서 최고가를 찍고 조정에 들어간 모습에서 2020년 3월20일 16686원에서 마무리한 이후 2021년 9월6일 125708원에서 고점을 찍고 밀렸으나 2023년 10월24일 26100원에서 저점을 찍은 모습입니다. 이후 2024년 3월20일 110000원에서 고점을 찍고 밀렸으나 작년 8월4일 26650원에서 저점을 찍은 후 등락을 보이는 가운데 점차 저점과 고점을 높혀오는 모습에서 11월6일 82900원에서 고점을 찍고 밀렸으나 올 3월4일 41200원에서 저점을 찍은 후 등락을 보이는 가운데 저점과 고점을 높혀오는 모습에서 30일 70500원에서 고점을 찍고 밀리는 중으로, 이제부턴 밀릴때마다 물량 모아둘 기회로 보여집니다.

손절점은 58600원으로 보시고 최대한 저점을 노리시면 되겠습니다. 61000원 전후면 무난해 보이며 분할매수도 고려해 볼수 있겠습니다.목표가는 1차로 67200원 부근에서 한번 차익실현을 고려해 보시고 이후 눌릴시 지지되는 저점에서 재공략 하시면 되겠습니다. 2차는 74000원 이상을 기대 합니다.

감사합니다.

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